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Thomsen等利用背负式水体基因采样系统从丹麦的一个海洋生态系统中采集海水,利用环境DNA metabarcoding技术研究海洋鱼类生物多样性。在获得的环境DNA中发现了15种不同的鱼类,其中包括一些用传统监测方法很难发现的稀有物种。同时与9种传统的海洋鱼类调查方法比较,环境DNA检测出的鱼类多样性与其他传统方法相当,甚至优于传统方法。Thomsen等[10]研究表明从湖泊、池塘和河流的少量水样中直接获得DNA,可以检测并定量分析研究区域内珍稀及濒危淡水动物(两栖类、鱼类、哺乳类、昆虫类和甲壳类)多样性。同时表明通过池塘水中分离的DNA,利用第二代测序技术可以检测到研究区域内两栖类和鱼类群体,环境DNA可以作为监测珍稀濒危物种的工具,应用于更广泛的物种监测中。
应用背负式水体基因采样系统不仅可以针对当前的生物多样性进行有效的评估,也可以对过去的动植物群落的多样性进行评估[11, 45]。Epp等[11]通过对过去和现在的环境DNA进行metabarcoding研究,所有目标类群都能通过metabarcoding的方法检测出来,但是类群之间和不同年代的环境样品所检测的结果存在较大变异范围。
目前国内在应用环境DNA metabarcoding技术研究生物多样性的报道还比较少。


